蓝莓苗的病害主要有僵果病和灰霉病。僵果病是由真菌引起的疾病，可使新叶、芽、茎干、花序等萎蔫，使果实因失水脱落。防治该病害，一是及时清除果园内的落叶、落果，可有效降低僵果病的发生；二是在蓝莓苗开花前进行浅耕并施加适量的尿素，可以减轻该病害的发生；三是在早春季节喷施0.5%的尿素、开花前喷施50%速克灵或20%嗪胺灵均可对该病进行有效的防治。灰霉病主要是因温室内湿度过大而引起的疾病，可以通过以下措施进行预防：一是扣棚前清除残留枯枝落叶，减少病原菌残留；二是扣棚后升温前喷施石硫合剂进行消毒处理；三是及时通风，控制好湿度和温度，减少灰霉病发生概率。蓝莓苗害虫较少，目前发现的主要有蚜虫和金龟子幼虫，蚜虫主要危害叶片、嫩等部位，金龟子幼虫危害根系。虫害不严重时应以人工捕杀为主，尽量避免使用农药；害虫大量发生时，宜选用低毒、环保药剂进行控制。